Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EFNA3P52797 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms