Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERFP50548 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ERFP50548 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERFP50548 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERFP50548 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms