Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRIM1P49642 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRIM1P49642 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms