Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXA1P49639 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms