Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD4P46934 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms