Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACADSBP45954 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms