Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NKX2-1P43699 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms