Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRATP43155 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRATP43155 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRATP43155 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRATP43155 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRATP43155 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRATP43155 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRATP43155 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRATP43155 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRATP43155 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRATP43155 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms