Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCAMP43121 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCAMP43121 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCAMP43121 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCAMP43121 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCAMP43121 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCAMP43121 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MCAMP43121 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MCAMP43121 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCAMP43121 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCAMP43121 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCAMP43121 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCAMP43121 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCAMP43121 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCAMP43121 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCAMP43121 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCAMP43121 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCAMP43121 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCAMP43121 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCAMP43121 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCAMP43121 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCAMP43121 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCAMP43121 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCAMP43121 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCAMP43121 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCAMP43121 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MCAMP43121 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCAMP43121 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCAMP43121 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCAMP43121 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCAMP43121 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCAMP43121 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCAMP43121 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCAMP43121 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCAMP43121 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCAMP43121 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCAMP43121 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCAMP43121 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCAMP43121 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCAMP43121 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCAMP43121 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCAMP43121 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCAMP43121 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCAMP43121 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCAMP43121 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCAMP43121 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCAMP43121 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCAMP43121 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCAMP43121 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCAMP43121 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCAMP43121 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCAMP43121 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCAMP43121 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCAMP43121 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCAMP43121 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCAMP43121 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCAMP43121 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MCAMP43121 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCAMP43121 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCAMP43121 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCAMP43121 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCAMP43121 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCAMP43121 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCAMP43121 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCAMP43121 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCAMP43121 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCAMP43121 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCAMP43121 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCAMP43121 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCAMP43121 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCAMP43121 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCAMP43121 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCAMP43121 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCAMP43121 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCAMP43121 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCAMP43121 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCAMP43121 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCAMP43121 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCAMP43121 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms