Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP6V1E1P36543 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms