Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXA10P31260 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA10P31260 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms