Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC27P30260 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC27P30260 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC27P30260 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC27P30260 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC27P30260 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC27P30260 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC27P30260 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC27P30260 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC27P30260 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC27P30260 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC27P30260 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC27P30260 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC27P30260 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC27P30260 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC27P30260 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC27P30260 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC27P30260 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC27P30260 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC27P30260 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC27P30260 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC27P30260 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC27P30260 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC27P30260 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC27P30260 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC27P30260 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDC27P30260 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC27P30260 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC27P30260 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC27P30260 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC27P30260 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC27P30260 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC27P30260 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC27P30260 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC27P30260 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC27P30260 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC27P30260 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC27P30260 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC27P30260 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC27P30260 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC27P30260 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC27P30260 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC27P30260 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC27P30260 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC27P30260 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC27P30260 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC27P30260 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC27P30260 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC27P30260 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC27P30260 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC27P30260 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC27P30260 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC27P30260 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC27P30260 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC27P30260 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC27P30260 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC27P30260 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC27P30260 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC27P30260 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC27P30260 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC27P30260 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC27P30260 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC27P30260 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC27P30260 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC27P30260 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC27P30260 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC27P30260 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC27P30260 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC27P30260 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC27P30260 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC27P30260 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms