Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB2P29033 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GJB2P29033 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB2P29033 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB2P29033 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB2P29033 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB2P29033 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB2P29033 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB2P29033 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB2P29033 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB2P29033 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB2P29033 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB2P29033 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB2P29033 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB2P29033 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB2P29033 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB2P29033 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB2P29033 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB2P29033 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB2P29033 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB2P29033 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJB2P29033 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB2P29033 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB2P29033 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB2P29033 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB2P29033 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB2P29033 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB2P29033 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB2P29033 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB2P29033 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB2P29033 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB2P29033 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB2P29033 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB2P29033 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB2P29033 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB2P29033 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJB2P29033 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB2P29033 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB2P29033 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB2P29033 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB2P29033 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB2P29033 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB2P29033 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB2P29033 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB2P29033 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB2P29033 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB2P29033 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB2P29033 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB2P29033 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB2P29033 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB2P29033 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB2P29033 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB2P29033 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJB2P29033 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB2P29033 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB2P29033 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB2P29033 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB2P29033 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJB2P29033 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms