Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP1P28562 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms