Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB2P26583 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms