Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRGP23470 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
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