Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERBB3P21860 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERBB3P21860 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERBB3P21860 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERBB3P21860 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERBB3P21860 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERBB3P21860 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERBB3P21860 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ERBB3P21860 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERBB3P21860 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERBB3P21860 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERBB3P21860 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERBB3P21860 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERBB3P21860 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ERBB3P21860 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ERBB3P21860 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms