Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1P21675 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1P21675 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1P21675 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TAF1P21675 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TAF1P21675 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1P21675 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1P21675 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1P21675 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1P21675 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1P21675 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1P21675 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1P21675 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1P21675 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1P21675 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1P21675 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1P21675 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1P21675 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1P21675 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1P21675 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1P21675 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1P21675 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TAF1P21675 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TAF1P21675 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1P21675 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1P21675 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1P21675 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1P21675 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1P21675 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1P21675 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1P21675 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1P21675 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1P21675 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1P21675 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1P21675 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1P21675 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1P21675 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TAF1P21675 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF1P21675 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF1P21675 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TAF1P21675 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms