Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP1P21291 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP1P21291 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP1P21291 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP1P21291 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP1P21291 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP1P21291 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP1P21291 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP1P21291 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP1P21291 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP1P21291 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CSRP1P21291 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSRP1P21291 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms