Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PVALBP20472 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PVALBP20472 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PVALBP20472 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms