Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDSP20132 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDSP20132 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDSP20132 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDSP20132 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDSP20132 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDSP20132 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDSP20132 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms