Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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PDE6GP18545 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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PDE6GP18545 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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PDE6GP18545 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PDE6GP18545 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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