Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

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Length 629 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMPD1P17405 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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