Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NME1P15531 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NME1P15531 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NME1P15531 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME1P15531 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME1P15531 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NME1P15531 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME1P15531 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME1P15531 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME1P15531 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME1P15531 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME1P15531 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME1P15531 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME1P15531 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME1P15531 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME1P15531 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME1P15531 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME1P15531 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME1P15531 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME1P15531 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME1P15531 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME1P15531 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NME1P15531 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME1P15531 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME1P15531 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
NME1P15531 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME1P15531 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NME1P15531 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms