Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM27P14373 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms