Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DOBP13765 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms