Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LYL1P12980 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LYL1P12980 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LYL1P12980 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms