Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD28P10747 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD28P10747 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD28P10747 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD28P10747 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms