Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms