Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VSIG8P0DPA2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VSIG8P0DPA2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms