Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGB3P0DN86 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGB3P0DN86 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms