Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L5P0DN76 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L5P0DN76 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L5P0DN76 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L5P0DN76 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L5P0DN76 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L5P0DN76 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L5P0DN76 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L5P0DN76 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L5P0DN76 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L5P0DN76 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L5P0DN76 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L5P0DN76 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L5P0DN76 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
U2AF1L5P0DN76 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2AF1L5P0DN76 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms