Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAA1P0DJI8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA1P0DJI8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms