Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00032P0C843 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00032P0C843 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms