Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VIL1P09327 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VIL1P09327 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VIL1P09327 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VIL1P09327 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VIL1P09327 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VIL1P09327 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIL1P09327 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIL1P09327 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIL1P09327 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIL1P09327 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIL1P09327 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIL1P09327 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIL1P09327 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIL1P09327 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIL1P09327 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIL1P09327 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VIL1P09327 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VIL1P09327 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIL1P09327 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIL1P09327 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIL1P09327 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIL1P09327 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIL1P09327 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIL1P09327 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIL1P09327 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIL1P09327 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIL1P09327 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIL1P09327 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIL1P09327 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VIL1P09327 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VIL1P09327 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIL1P09327 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIL1P09327 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIL1P09327 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIL1P09327 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIL1P09327 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIL1P09327 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIL1P09327 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VIL1P09327 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIL1P09327 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIL1P09327 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIL1P09327 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIL1P09327 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIL1P09327 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIL1P09327 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIL1P09327 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIL1P09327 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIL1P09327 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIL1P09327 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIL1P09327 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIL1P09327 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms