Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSF2P04141 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSF2P04141 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSF2P04141 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSF2P04141 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSF2P04141 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSF2P04141 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSF2P04141 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSF2P04141 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSF2P04141 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSF2P04141 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSF2P04141 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSF2P04141 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSF2P04141 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CSF2P04141 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSF2P04141 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSF2P04141 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSF2P04141 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSF2P04141 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSF2P04141 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSF2P04141 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSF2P04141 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSF2P04141 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSF2P04141 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSF2P04141 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSF2P04141 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSF2P04141 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSF2P04141 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CSF2P04141 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSF2P04141 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSF2P04141 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSF2P04141 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSF2P04141 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSF2P04141 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSF2P04141 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSF2P04141 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSF2P04141 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSF2P04141 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSF2P04141 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSF2P04141 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSF2P04141 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSF2P04141 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSF2P04141 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSF2P04141 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSF2P04141 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSF2P04141 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CSF2P04141 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSF2P04141 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms