Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBA3O96018 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APBA3O96018 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APBA3O96018 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APBA3O96018 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APBA3O96018 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APBA3O96018 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APBA3O96018 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APBA3O96018 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APBA3O96018 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APBA3O96018 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APBA3O96018 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APBA3O96018 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APBA3O96018 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APBA3O96018 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBA3O96018 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA3O96018 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA3O96018 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA3O96018 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA3O96018 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA3O96018 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA3O96018 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA3O96018 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA3O96018 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA3O96018 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA3O96018 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA3O96018 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA3O96018 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA3O96018 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA3O96018 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA3O96018 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA3O96018 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA3O96018 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA3O96018 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBA3O96018 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA3O96018 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA3O96018 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA3O96018 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA3O96018 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA3O96018 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA3O96018 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA3O96018 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA3O96018 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA3O96018 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA3O96018 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA3O96018 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA3O96018 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA3O96018 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA3O96018 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA3O96018 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBA3O96018 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APBA3O96018 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APBA3O96018 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms