Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG12O94817 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATG12O94817 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG12O94817 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG12O94817 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG12O94817 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG12O94817 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG12O94817 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG12O94817 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATG12O94817 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATG12O94817 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms