Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FLOT1O75955 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FLOT1O75955 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms