Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F6O75461 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F6O75461 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F6O75461 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms