Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PPFIA3O75145 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPFIA3O75145 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms