Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LANCL1O43813 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms