Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYNGR2O43760 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms