Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPRY3O43610 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms