Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA1GO43497 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms