Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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HOXA3O43365 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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HOXA3O43365 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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HOXA3O43365 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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HOXA3O43365 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXA3O43365 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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