Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACOX3O15254 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACOX3O15254 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms