Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NEDD8-MDP1E9PL57 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms