Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX1

FAM223B, Protein FAM223B, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM223BA6NKX1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM223BA6NKX1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM223BA6NKX1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms