Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC182A6NF36 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC182A6NF36 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms